El Presidente Autonómico es el máximo órgano unipersonal del Partido en La Rioja, correspondiéndole su gobierno y representación. Sus competencias están reguladas en el Artículo 51 del Reglamento de Organización aprobado en el Congreos Autonómico.
Desde el 20 de octubre de 2022, el Presidente electo del Partido Popular de La Rioja es Alberto Galiana.